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自建网页版Blast网站
简介
- 通常数据库网站或者提供原始数据集的时候会提供一个在线版本的blast服务。
- 与NCBI blast相比,自建blast可以内置自定义库并且放置在特定的位置。
- 关于服务器、域名解析、备案等这里不讲。本地运行即可开发测试。
1. SequenceServer
- 主要依赖为ruby>2.3和RubyGems
安装
- 首先安装依赖ruby
Ruby:
https://www.ruby-lang.org/en/documentation/installation/#apt
- 安装 sequenceserver
Refer:
2. pyBlastWeb
This is a python script for online blast. All the calculate operation is online. Users can put it in their own website with only little resource (only need network,ncbi blast provide the calculating server).
pyBlastWeb
jinhuili-lab • Updated Feb 20, 2025
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- Author:李金辉
- URL:https://jinhuili-lab.github.io/blog/article/blast%2B
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